刘海燕

刘海燕

2022-10-06来源:生命科学学院


  

主要研究兴趣

1) 蛋白质空间结构和动力学的计算机模拟方法与应用;

2) 蛋白质设计理论与实验方法及其在合成生物学中的应用。


教授 博士生导师 1990年本科博士毕业于中国科学技术大学生物系 1996年博士毕业于中国科学技术大学 获郭沫若奖 1993-1995年作为联合培养研究生在瑞士苏黎世高等理工学院物理化学实验室学习 1998-2000年在杜克大学和北卡罗来纳大学博士后。

现为我校生命科学与医学部教授、博士生导师。在生物分子计算机模拟与设计方法和酶催化模拟领域发表研究论文六十余篇。2001年获“国家杰出青年基金”资助。2004年获安徽省青年科技奖。


实验室主页:http://biocomp.ustc.edu.cn/

 

近期代表性论文:  

1. Yufeng Liu, Sheng Wang, Jixin Dong, Linghui Chen, Xinyu Wang, Lei Wang, Fudong Li, Chenchen Wang, Jiahai Zhang, Yuzhu Wang, Si Wei, Quan Chen*, Haiyan Liu*De novo protein design with a denoising diffusion network independent of pre-trained structure prediction models Nature Methods, 2024, DOI: 10.1038/s41592-024-02437-w.

2. Xu, Yang; Hu, Xiuhon; Wang, Chenchen; Liu, Yongrui Liu; Chen, Quan*; Liu, Haiyan*; De novo Design of Cavity-containing Proteins with a Backbone-centred Neural Network Energy Function, Structure, 2024, 32(4), 424-432. DOI:10.1016/j.str.2024.01.006

3. Hu, Xiuhong; Xu, Yang; Wang, Chenchen; Liu, Yufeng Liu; Zhang, Lu; Zhang, Jiahai; Wang, Wenning*; Chen, Quan*; Liu, Haiyan*; Combined prediction and design reveals the target recognition mechanism of an intrinsically disordered protein interaction domain; Proc Natl Acad Sci USA, 2023;120:2305603120.

4. Liu, Yufeng; Zhang, Lu; Wang, Weilun; Zhu, Min; Wang, Chenchen; Li, Fudong;, Zhang, Jiahai; Li, Houqiang; Chen, Quan*; Liu, Haiyan*; Rotamer-free protein sequence design based on deep learning and self-consistency, Nature Computational Science, 2022,2, 451–462.

5. Huang, Bin; Xu. Yang; Hu,Xiuhon; Liu, Yongrui; Liao, Shanhui; Zhang, Jiahai; Huang, Chengdong; Hong, Jingjun; Chen, Quan*; Liu, Haiyan*; A backbone-centred energy function of neural networks for protein design; Nature, 2022, 602(7897):523-528.

 

联系方式

Tel: 86-551-63607450

Fax: 86-551-63607450

e-mail: hyliu@ustc.edu.cn


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