邢宇航

邢宇航

2022-01-06来源:生命科学与医学部




研究兴趣与方向:

真核生物的基因转录调控机制是细胞生物学中一个极其复杂且精细的过程。这种机制不仅决定了细胞如何分化和发育,而且还确保了多细胞生物能够正常生存和功能。在细胞的生命周期中,基因转录调控机制确保了特定的基因在正确的时间和地点表达,这对于维持细胞的稳定性和响应环境变化至关重要。然而,当这一精细调控过程出现故障时,可能会导致严重的疾病,尤其是癌症。癌症的发生和发展与基因表达调控的异常密切相关,这种异常可能涉及到多个层面的因素,包括染色质的状态、表观遗传的重塑、转录因子及其辅助因子的招募等。由此可见,解析癌细胞中转录调控的分子机制对了解癌症的成因以及临床治疗至关重要。围绕这一关键研究方向,为阐明基因表达调控在癌细胞中的作用机理,实验室拟开展下述方向研究:

1. 研究癌细胞中由RNA介导的基因转录调控。RNA分子在基因表达调控中扮演着多种角色,包括作为信号分子、调节分子和结构分子。我们特别关注非编码RNAnoncoding RNA)和增强子RNAenhancer RNA)在转录调控中的作用,以及它们如何影响癌细胞的生长和存活。

2. 细胞有丝分裂过程中关键转录因子的鉴定研究。有丝分裂是重要的生物学过程,此过程中的基因表达调控对于细胞的增殖和分化至关重要。我们将识别和研究那些在有丝分裂过程中起关键作用的转录因子,以及它们如何影响细胞周期的进程。

3. 探索三维基因组结构(3D genome organization)与基因转录调控之间的关系。近年来,三维基因组结构的研究揭示了基因组的空间组织对基因表达的调控作用。我们将利用先进的基因组学技术以及超高分辨率成像方法来研究基因组的空间结构如何影响基因的转录活性。


个人介绍:

邢宇航,中国科学技术大学生命科学与医学部特任教授,博士生导师。2012年本科毕业于南京大学,2018年博士毕业于中科院上海生命科学研究院。2018年至2023年在哈佛大学医学院从事博士后研究。20237月加入中国科学技术大学生命科学与医学部担任特任教授,组建基因转录调控实验室。其长期从事表观遗传学研究,致力于揭示癌症中基因转录调控的分子机理,探究不同时空尺度下基因选择性表达的奥秘。相关研究以第一作者身份发表于CellNature Biotechnology等杂志,并发表相关综述多篇对研究领域进行了系统总结。曾获得中国科学院优秀博士学位论文、中国科学院大学优秀毕业生以及中国科学院院长特别奖等荣誉。目前实验室主要从基因组学、分子生物学、高分辨率显微成像等角度研究癌症中基因转录的分子调控机制。

 

课题组招聘:

1)课题组长期招聘博士后。计算生物学背景者优先考虑,其它招聘方向包括但不限于细胞生物学、分子生物学、生物化学以及遗传学等。

2)研究生:热烈欢迎对本课题组方向感兴趣的同学加入课题组,攻读学位。

欢迎大家选择我们课题组,在这里我将努力营造出一个积极向上、温馨和睦的研究生活氛围。力争让每个实验室成员都能愉悦健康地成长进步,以积极乐观的态度去探索科学上的未知奥秘!

 

联系方式:

办公室:中国科学技术大学西校区医算楼444

电话:0551-63603943

邮箱:yhxing@ustc.edu.cn

 

已发表文章(#第一作者, *通讯作者)

Xing YH#, Dong R#, Lee L, Rengarajan S, Riggi N, Boulay G, Rivera MN*. DisP-seq reveals the genome-wide functional organization of DNA-associated disordered proteins. Nat Biotechnol. 2023, 42(1):52-64.

Rajendran S#, Dong R#, Lee L, Xing YH, Iyer S et al. Highly connected 3D chromatin networks established by an oncogenic fusion protein shape tumor cell identity. Sci Adv. 2023, 9(13): eabo3789.

Yasuhara T, Xing YH, Bauer N, Lee L, Dong R, Yadav T, Soberman R, Rivera MN, Zou L*. Condensates induced by transcription inhibition localize active chromatin to nucleoli. Mol Cell. 2022, 82(15): 2738-2753.

Möller E, Praz V, Rajendran S, Dong R, Cauderay A, Xing YH et al. EWSR1-ATF1 dependent 3D connectivity regulates oncogenic and differentiation programs in Clear Cell Sarcoma. Nat Commun. 2022, 13(1): 2267.

Wu M#, Xu G#, Han C#, Luan PF, Xing YH, Nan F, Yang LZ, Huang YK, Yang ZH, Shan L, Yang L, Liu JQ* and Chen LL*. lncRNA SLERT controls phase separation of FC/DFCs to facilitate Pol I transcription. Science. 2021, 373(6554): 547-555.

Boulay G#, Cironi L#, Garcia S.P, Rengarajan S, Xing YH et al. The chromatin landscape of primary synovial sarcoma organoids is linked to specific epigenetic mechanisms and dependencies. Life science alliance. 2020, 4(2): e202000808.

Guo CJ#, Ma XK#, Xing YH, Zheng CC, Xu YF, Shan L, Zhang J, Wang SH, Wang YM, Carmichael GG, Yang L and Chen LL*. Distinct processing of lncRNAs contributes to non-conserved functions in stem cells. Cell. 2020, 181(3): 621-636.

Yao RW#, Xu G#, Wang Y, Shan L, Luan PF, Wang Y, Wu M, Yang LZ, Xing YH, Yang L, Chen LL*. Nascent Pre-rRNA Sorting via Phase Separation Drives the Assembly of Dense Fibrillar Components in the Human Nucleolus. Mol Cell. 2019, 76(5): 767-783.

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Xing YH, Chen LL*. Long Noncoding RNAs Stabilized by Small Nucleolar RNA-Protein (snoRNP) Ends. Chinese Journal of Cell Biology. 2017, 39: 1261-1267.

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