郑基深

郑基深

2022-01-05来源:生命科学学院



主要研究方向蛋白质化学与合成生物学。 

1)基于生物/化学以及人工智能技术,发展生物正交反应新策略,用于蛋白质离体和在体的结构修饰及功能调控与重构;

2)基于新型筛选和进化技术,快速获得蛋白类药物分子和新型酶等定制功能蛋白质;

3)生物正交反应驱动的抗体类和细胞药物开发。

 

中国科学技术大学生命科学与医学部教授,博士生导师,国家基金委优秀青年基金获得者。主要研究方向是蛋白质化学与合成生物学,近年来以通讯作者在J Am Chem Soc, Angew Chem Int Ed, Chem, Science Advance, Nature Protocols等期刊发表研究成果50余篇,作为课题负责人获得国家基金委优秀青年基金、基金委重大研究计划培育项目、面上项目和科技部重点研发计划课题等基金资助。

 

教育经历: 

2002-2006年,中国科学技术大学化学与材料科学学院,本科; 

2006-2012年,中国科学技术大学化学系,博士;

 

工作经历:

2012-2014年,清华大学化学系,博士后;

2014-2016年,中国科学院合肥物质科学研究院,副研究员;

2016-2020年,中国科学技术大学生命科学与医学部,研究员;

2021-至今,中国科学技术大学生命科学与医学部,教授。

 

课题组招聘:

实验室常年招收生物学/化学生物学/生物医学等交叉学科研究生、博士后和特任副研究员。

1)博士生或硕士生。欢迎对生物学/化学生物学/生物医学等交叉学科感兴趣的同学加入课题组,攻读博士学位。

2)特任副研究员和博士后。具有蛋白质生物/化学合成、噬菌体筛选、蛋白质功能进化、抗体药物开发和免疫细胞疗法等相关背景科研人员。

 简历请发送至:jszheng@ustc.edu.cn

 

近五年代表性成果(通讯作者)

1. Qi, Y.-K.; Zheng, J. S.*; Liu, L.* Mirror-image protein and peptide drug discovery through mirror-image phage display. Chem 202410 (8), 2390-2407.

2. Dong-Liang Huang; Wu-Chen Guo; Wei-Wei Shi; Yun-Pu Gao; Yong-Kang Zhou; Long-Jie Wang; Chen Wang; Tang, S.*; Liu, L.*Zheng, J. S.*Enhanced Native Chemical Ligation by Peptide Conjugation in Trifluoroacetic Acid. Sci. Adv.202410, eado9413.

3. Zheng, Y.; Zhang, B.; Shi, W. W.; Deng, X.; Wang, T. Y.; Han, D.; Ren, Y.; Yang, Z.; Zhou, Y. K.; Kuang, J.; Wang, Z.W.; Tang, S.; Zheng, J. S.*An Enzyme-Cleavable Solubilizing-Tag Facilitates the Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins. Angew. Chem. Int. Ed.202463, e202318897.

4. Shi, W. W.; Wang, T. Y.; Yang, Z. Y.; Ren, Y. X.; Han, D. Y.; Zheng, Y. P.; Deng, X. Y.; Tang, S.; Zheng, J. S.*, L-Glycosidase-Cleavable Natural Glycans Facilitate the Chemical Synthesis of Correctly Folded Disulfide-Bonded D-Proteins. Angew. Chem. Int. Ed.202463, e202313640.

5. Zhang, B.; Zheng, Y.; Chu, G.; Deng, X.; Wang, T.; Shi, W.; Zhou, Y.; Tang, S.; Zheng, J. S.*; Liu, L.*, Backbone‐Installed Split Intein‐Assisted Ligation for the Chemical Synthesis of Mirror‐Image Proteins.Angew. Chem. Int. Ed.2023,62 (33), e202306270.

6. Li, Y.; Wang, L.-J.; Zhou, Y.-K.; Liang, J.; Xiao, B.; Zheng, J. S.*, An improved installation of 2-hydroxy-4-methoxybenzyl (iHmb) method for chemical protein synthesis. Chin Chem Lett2024, 109033.

7. Gao, Y.-P.; Sun, P.-F.; Guo, W.-C.; Zhou, Y.-K.; Zheng, J. S.*; Tang, S.* Chemical synthesis of a 28 kDa full-length PET degrading enzyme ICCG by the removable backbone modification strategy. Bioorg. Chem. 2024143, 107047.

8. Ding, R. C.; Shi, W. W.; Zheng, J. S.,Chemically Synthetic D-Sortase Enables Enzymatic Ligation of D-PeptidesOrg Lett 2023,25 (26), 4857-4861.

9.Han, D. Y.; Ren, Y. X.; Yang, Z. Y.; Huang, H.; Zheng, J. S.*Split Intein: a Versatile Tool for Traceless Peptide Segment LigationChem J Chinese U2023,44 (10), 20230188.

10. Shi, W. W.; Shi, C.; Wang, T. Y.; Li, Y. L.; Zhou, Y. K.; Zhang, X. H.; Bierer, D.; Zheng, J. S.*; Liu, L.*, Total Chemical Synthesis of Correctly Folded Disulfide-Rich Proteins Using a Removable O-Linked beta-N-Acetylglucosamine Strategy. J. Am. Chem. Soc.2022,144 (1), 349-357.

11. Li, Y.; Heng, J.; Sun, D.; Zhang, B.; Zhang, X.; Zheng, Y.; Shi, W. W.; Wang, T. Y.; Li, J. Y.; Sun, X.; Liu, X.; Zheng, J. S.*; Kobilka, B. K.; Liu, L.*Chemical Synthesis of a Full-Length G-Protein-Coupled Receptor beta2-Adrenergic Receptor with Defined Modification Patterns at the C-TerminusJ. Am. Chem. Soc.2021,143 (42), 17566-17576.

12. Li, Y.; Cao, X.; Tian, C.; Zheng, J. S.*,Chemical protein synthesis-assisted high-throughput screening strategies for d-peptides in drug discoveryChin. Chem. Lett2020,31 (9), 2365-2374.

13. Huang, D.-L.; Li, Y.; Liang, J.; Yu, L.; Xue, M.; Cao, X.-X.; Xiao, B.; Tian, C.-L.; Liu, L.; Zheng, J. S.*The New Salcylaldehyde S,S-Propanedithioacetal Ester Enables N-to-C Sequential Native Chemical Ligation and Ser/Thr Ligation for Chemical Protein Synthesis.J. Am. Chem. Soc. 2020,142 (19), 8790-8799.

14. Huang, D. L.; Montigny, C.; Zheng, Y.; Beswick, V.; Li, Y.; Cao, X. X.; Barbot, T.; Jaxel, C.; Liang, J.; Tian, C. L.; Jamin, N.; Zheng, J. S.*. Chemical Synthesis of Native S-palmitoylated Membrane Proteins through Reversible Backbone Modification Assisted Ser/Thr Ligation. Angew. Chem. Int. Ed2020,59 (13), 5178-5184.

15. Qu, Q.; Gao, S.; Wu, F. M.; Zhang, M. G.; Li, Y; Zhang, L. H., Donald Bierer, Tian, C. L.*, Zheng, J. S.*; Liu, L.*Synthesis of disulfide surrogate peptides incorporating large-span surrogate bridges through a native chemical ligation-assisted diaminodiacid strategyAngew. Chem. Int. Ed.2020, 59 (15), 6037-6045.

16. Zhang, B.; Deng, Q.; Zuo, C.; Yan, B.; Zuo, C.; Cao, X. X.; Zhu, T. F.; Zheng, J. S.*; Liu, L.*,Ligation of Soluble but Unreactive Peptide Segments in the Chemical Synthesis of Haemophilus Influenzae DNA Ligase.Angew. Chem. Int. Ed.2019, 58, 12231-12237.

17. Qi, Y.-K.*; Si, Y.-Y.; Du, S.-S.; Liang, J.; Wang, K.-W.*; Zheng, J. S.*Recent advances in the chemical synthesis and semi-synthesis of poly-ubiquitin-based proteins and probesSci. China Chem.2019,62 (3), 299-312.

18. Guo, Q. Y.; Zhang, L. H.; Zuo, C.; Huang, D. L.; Wang, Z. A.; Zheng, J. S.*; Tian, C. L.*,Channel activity of mirror-image M2 proton channel of influenza A virus is blocked by achiral or chiral inhibitors.Protein Cell201910211-216.

 

主持的在研科研项目:

1. 国家自然科学基金面上项目仿生酶促可逆糖基修饰新策略辅助蛋白质化学合成,主持,2024-2027年。

2. 合肥综合性国家科学中心大健康研究院前沿交叉科学与生物医学研究所专项,靶向神经退行性疾病中翻译后修饰病理凝聚物的多肽药物开发,主持,2024-2026年。

3. 国家自然科学基金面上项目,翻译后修饰G蛋白偶联受体(GPCR)的化学合成及其调控机制研究,主持,2022-2025年。

4. 中国科学院合肥大科学中心协同创新培育基金,镜像蛋白修饰石墨烯量子点用于肿瘤特异性诊疗研究,主持,2022-2024年。

5. 国家重点研发计划,合成塑料高效生物降解的关键技术-课题二:合成塑料降解酶晶体结构及催化机制解析,主持,2019-2024年。

6. 国家自然科学基金优秀青年科学基金,疏水蛋白的化学合成与调控,主持,2020-2023年。


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电子邮箱jszheng@ustc.edu.cn

电话0551-63607782


 



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